Дыхательные пути занимают второе место по частоте поражения при повышенной чувствительности к коровьему молоку. Симптомы варьируют от слабого насморка до тяжелых заболеваний легких. Большинство респираторных симптомов при аллергии к молоку опосредовано IgE. Однако при хронических легочных заболеваниях, по-видимому, доминирующими являются реакции иммунных комплексов и клеточного иммунитета.