Четвертичные аммониевые соединения по широте антибактериального спектра уступают хлорсодержащим веществам и производным фенола, но хорошая растворимость в воде, отсутствие запаха, а также коррозирующих свойств, сравнительно невысокая токсичность для человека делают эти соединения ценными дезинфицирующими средствами. Четвертичные аммониевые соединения эффективны в отношении бактерий и грибов.
Микобактерии туберкулеза и споры бактерий устойчивы к действию даже концентрированных растворов, в связи с чем эти вещества не применяют для обеззараживания при туберкулезе, сибирской язве и др.
Наиболее активными отечественными препаратами из этой группы соединений являются катапин и катионат, обладающие бактерицидной активностью в 0,5 — 1% растворах. Препараты применяют для дезинфекции при кишечных заболеваниях, для обеззараживания в родильных домах, на заводах медицинских препаратов и т. п.